DNA→RNA
DNA → RNA 转录
将 DNA 序列转录为 RNA。
长度：0 个碱基
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功能简介
本工具把按 5' → 3' 书写的 DNA 编码链转录为对应的 RNA 序列，做法是将每个胸腺嘧啶（T）替换为尿嘧啶（U），长度、顺序和方向性全部保持不变。非标准碱基字符原样保留，因此简并碱基和格式不会在转换中丢失。教学中它让 DNA 与 RNA 的对应关系变得直观，实验中则常用于在订购或折叠预测之前写出 mRNA、向导 RNA 或探针序列。
原理与公式
在细胞内，RNA 聚合酶结合模板链并沿 3' → 5' 方向读取，同时按 5' → 3' 方向合成 RNA，逐位加入互补的核糖核苷酸。其结果是：RNA 产物的序列与编码链完全一致，只是以尿嘧啶取代胸腺嘧啶，因此整个转换简化为一条替换规则 T → U（t → u）。其余都不改变：长度相同，不做反向也不做互补，5' → 3' 取向保持不变。这一简化只对编码链成立；若粘贴的是模板链，必须先取其反向互补序列，否则得到的是反义 RNA 而不是信使 RNA。
演算示例
编码链 5'-ATGGCTTAA-3' 转录为 RNA 5'-AUGGCUUAA-3'。位于第 2、6、7 位的三个 T 被替换为 U，长度仍为 9 个核苷酸，阅读框不受影响，因此 AUG 依然是起始密码子、UAA 依然是终止密码子。按密码子读取，AUG GCU UAA 依次编码甲硫氨酸、丙氨酸，随后终止。
适用场景
当你手上是编码序列、而需要 mRNA 来对照密码子表或完成翻译练习时，把 T 换成 U 就得到了遗传密码所使用的书写形式。订购体外转录探针、向导 RNA 或反义寡核苷酸时，明确写出 RNA 序列有助于在合成前核对 5' 端以及附加的前导序列。为 RNA 二级结构预测准备输入时，多数折叠工具要求使用 U 而非 T，转换后的序列可直接粘贴使用。
常见问题
- 编码链和模板链有什么区别？
- 模板链是 RNA 聚合酶实际读取的那条链，所以 RNA 与它互补。编码链是另一条链，除 T 与 U 的差别外序列与 RNA 相同，因此数据库和文献中通常书写的就是编码链。本工具默认你输入的是编码链。
- 转录会改变序列长度吗？
- 不会。尿嘧啶替换胸腺嘧啶是一对一的，因此 RNA 的核苷酸数与输入的 DNA 完全相同，每个位置的序号也保持不变。细胞内真实的转录当然还会加 5' 帽、poly-A 尾并切除内含子，但这些都不属于本工具的碱基级转换。
- 如果手上是模板链，怎么得到 RNA？
- 先把模板链转换为反向互补序列以获得编码链，再把 T 替换为 U。若省略反向互补这一步，得到的将是反义 RNA，它无法翻译出预期蛋白，对照密码子表读起来也毫无意义。
- 为什么 RNA 用尿嘧啶而不用胸腺嘧啶？
- 胸腺嘧啶本质上就是 5-甲基尿嘧啶，两者与腺嘌呤的配对方式相同，甲基对碱基配对本身并非必需。通常的解释是：DNA 保留甲基化形式，使得 DNA 中出现的尿嘧啶可以被识别为胞嘧啶脱氨造成的损伤并加以修复，而寿命短暂的 RNA 分子不需要这层保障。