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密码子表

密码子表

标准遗传密码 —— 64 种密码子对应的氨基酸。

64 个密码子

密码子氨基酸(单字母)氨基酸(三字母)全名
TTTFPhePhenylalanine
TTCFPhePhenylalanine
TTALLeuLeucine
TTGLLeuLeucine
CTTLLeuLeucine
CTCLLeuLeucine
CTALLeuLeucine
CTGLLeuLeucine
ATTIIleIsoleucine
ATCIIleIsoleucine
ATAIIleIsoleucine
ATG起始MMetMethionine
GTTVValValine
GTCVValValine
GTAVValValine
GTGVValValine
TCTSSerSerine
TCCSSerSerine
TCASSerSerine
TCGSSerSerine
CCTPProProline
CCCPProProline
CCAPProProline
CCGPProProline
ACTTThrThreonine
ACCTThrThreonine
ACATThrThreonine
ACGTThrThreonine
GCTAAlaAlanine
GCCAAlaAlanine
GCAAAlaAlanine
GCGAAlaAlanine
TATYTyrTyrosine
TACYTyrTyrosine
TAA*StopStop
TAG*StopStop
CATHHisHistidine
CACHHisHistidine
CAAQGlnGlutamine
CAGQGlnGlutamine
AATNAsnAsparagine
AACNAsnAsparagine
AAAKLysLysine
AAGKLysLysine
GATDAspAspartic acid
GACDAspAspartic acid
GAAEGluGlutamic acid
GAGEGluGlutamic acid
TGTCCysCysteine
TGCCCysCysteine
TGA*StopStop
TGGWTrpTryptophan
CGTRArgArginine
CGCRArgArginine
CGARArgArginine
CGGRArgArginine
AGTSSerSerine
AGCSSerSerine
AGARArgArginine
AGGRArgArginine
GGTGGlyGlycine
GGCGGlyGlycine
GGAGGlyGlycine
GGGGGlyGlycine

工具描述

遗传密码定义了密码子(3 个核苷酸序列)如何翻译为氨基酸。标准密码表将 64 种密码子映射到 20 种氨基酸和终止信号。ATG(AUG)编码甲硫氨酸,同时作为起始密码子;TAA、TAG 和 TGA 是终止密码子。

使用说明

在 DNA(T)和 RNA(U)密码子之间切换。使用筛选框搜索特定氨基酸或密码子。点击任意行可高亮编码同一氨基酸的全部密码子。

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功能简介

密码子表工具展示标准遗传密码,将全部 64 种密码子映射到对应的氨基酸、起始和终止信号。学生、教师和实验人员常在克隆、诱变和序列解读时快速查询。标准遗传密码几乎为所有生物共用,因此细菌表达系统能翻译人类基因——但线粒体与少数微生物存在例外,个别密码子被重新分配。

原理与公式

遗传密码将密码子分为 64 种三联体组合:61 种编码 20 种标准氨基酸,3 种为终止信号。密码子的简并性意味着多数氨基酸由多个密码子指定,且只在第三位碱基不同的密码子通常编码同一氨基酸(摆动性)。ATG(RNA 中为 AUG)编码甲硫氨酸并作为起始密码子。第三位碱基的简并性让同义密码子家族共享前两位:GCN = 丙氨酸、CGN = 精氨酸。密码子优化算法在不改变蛋白的前提下按宿主 tRNA 丰度改写基因,利用的正是这一结构。

演算示例

CTT、CTC、CTA、CTG、TTA、TTG 全部编码亮氨酸,体现了简并性;ATG 编码甲硫氨酸并作为起始密码子,而 TAA、TAG、TGA 为终止密码子。单个碱基变化可能是同义的(CTT → CTC,仍是亮氨酸)、错义的(CTT → CAT,变成组氨酸)或无义的(TAC → TAG,产生终止子)——查表即可判断属于哪种情况。

适用场景

设计同义突变时查询编码某氨基酸的密码子。确认测序峰图中某个密码子对应的氨基酸。通过切换 DNA(T)与 RNA(U)形式来学习或讲授遗传密码结构。设计合成基因时可手动选密码子——例如在精氨酸的各密码子之间挑选,以避开编码区内被禁止的限制酶切位点。

常见问题

标准遗传密码共有多少个密码子?
共 64 个密码子:61 个编码 20 种氨基酸,3 个为终止信号。
哪个是起始密码子,它编码什么?
ATG(RNA 中为 AUG)是起始密码子,编码甲硫氨酸。
三个终止密码子是什么?
TAA、TAG、TGA(RNA 中为 UAA、UAG、UGA)终止翻译。
为什么多个密码子编码同一种氨基酸?
遗传密码具有简并性;冗余(尤其第三位碱基的摆动性)让多个密码子对应一个氨基酸,并提升对突变的耐受力。
密码子表怎么读?
密码子表列出全部 64 个三字母密码子及其编码的氨基酸。标准排法是第一位碱基排在左侧一列、第二位碱基排在顶部一行、第三位碱基填在格内,所以查 UUU 时沿 U 行、U 列找到 U 格,即苯丙氨酸。查表时按 mRNA 的 5’ → 3’ 方向读,并注意切换本工具的 DNA/RNA 开关:DNA 表把 U 写成 T,RNA 表把 T 写成 U,两者混用会让每个密码子都错位。终止密码子 UAA、UAG、UGA 标注为终止,而不对应任何氨基酸。
怎么查某种氨基酸对应的密码子?
用氨基酸名称或其单字母、三字母代码筛选表格,所有编码该氨基酸的密码子都会被高亮。每种氨基酸对应的密码子数量从 1 个(甲硫氨酸、色氨酸)到 6 个(亮氨酸、丝氨酸、精氨酸)不等,这正是密码子的简并性。同一种氨基酸的密码子通常前两位碱基相同、只有第三位(摆动位)不同,所以直接看 CUN 这样的密码子家族往往比在表里逐一查找更快。
如何对一条 DNA 序列做六个阅读框的翻译?
双链 DNA 有正向的 3 个阅读框(分别从第 1、2、3 位碱基起读)和反向互补链上的 3 个阅读框,共 6 种可能的翻译。做法是先按第 1、2、3 位分别翻译正链,再求出反向互补链并同样按三个框翻译。真正的蛋白是对应「以起始密码子开头、直到单个终止密码子结束且中间没有终止信号」的那一长串氨基酸的那一框,其余五个框会频繁出现终止密码子。本站的 DNA 翻译工具可直接完成六框翻译,而这里的密码子表用于核对某个具体密码子编码哪种氨基酸。