密码子表
密码子表
标准遗传密码 —— 64 种密码子对应的氨基酸。
64 个密码子
| 密码子 | 氨基酸(单字母) | 氨基酸(三字母) | 全名 |
|---|---|---|---|
| TTT | F | Phe | Phenylalanine |
| TTC | F | Phe | Phenylalanine |
| TTA | L | Leu | Leucine |
| TTG | L | Leu | Leucine |
| CTT | L | Leu | Leucine |
| CTC | L | Leu | Leucine |
| CTA | L | Leu | Leucine |
| CTG | L | Leu | Leucine |
| ATT | I | Ile | Isoleucine |
| ATC | I | Ile | Isoleucine |
| ATA | I | Ile | Isoleucine |
| ATG 起始 | M | Met | Methionine |
| GTT | V | Val | Valine |
| GTC | V | Val | Valine |
| GTA | V | Val | Valine |
| GTG | V | Val | Valine |
| TCT | S | Ser | Serine |
| TCC | S | Ser | Serine |
| TCA | S | Ser | Serine |
| TCG | S | Ser | Serine |
| CCT | P | Pro | Proline |
| CCC | P | Pro | Proline |
| CCA | P | Pro | Proline |
| CCG | P | Pro | Proline |
| ACT | T | Thr | Threonine |
| ACC | T | Thr | Threonine |
| ACA | T | Thr | Threonine |
| ACG | T | Thr | Threonine |
| GCT | A | Ala | Alanine |
| GCC | A | Ala | Alanine |
| GCA | A | Ala | Alanine |
| GCG | A | Ala | Alanine |
| TAT | Y | Tyr | Tyrosine |
| TAC | Y | Tyr | Tyrosine |
| TAA | * | Stop | Stop |
| TAG | * | Stop | Stop |
| CAT | H | His | Histidine |
| CAC | H | His | Histidine |
| CAA | Q | Gln | Glutamine |
| CAG | Q | Gln | Glutamine |
| AAT | N | Asn | Asparagine |
| AAC | N | Asn | Asparagine |
| AAA | K | Lys | Lysine |
| AAG | K | Lys | Lysine |
| GAT | D | Asp | Aspartic acid |
| GAC | D | Asp | Aspartic acid |
| GAA | E | Glu | Glutamic acid |
| GAG | E | Glu | Glutamic acid |
| TGT | C | Cys | Cysteine |
| TGC | C | Cys | Cysteine |
| TGA | * | Stop | Stop |
| TGG | W | Trp | Tryptophan |
| CGT | R | Arg | Arginine |
| CGC | R | Arg | Arginine |
| CGA | R | Arg | Arginine |
| CGG | R | Arg | Arginine |
| AGT | S | Ser | Serine |
| AGC | S | Ser | Serine |
| AGA | R | Arg | Arginine |
| AGG | R | Arg | Arginine |
| GGT | G | Gly | Glycine |
| GGC | G | Gly | Glycine |
| GGA | G | Gly | Glycine |
| GGG | G | Gly | Glycine |
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功能简介
密码子表工具展示标准遗传密码,将全部 64 种密码子映射到对应的氨基酸、起始和终止信号。学生、教师和实验人员常在克隆、诱变和序列解读时快速查询。标准遗传密码几乎为所有生物共用,因此细菌表达系统能翻译人类基因——但线粒体与少数微生物存在例外,个别密码子被重新分配。
原理与公式
遗传密码将密码子分为 64 种三联体组合:61 种编码 20 种标准氨基酸,3 种为终止信号。密码子的简并性意味着多数氨基酸由多个密码子指定,且只在第三位碱基不同的密码子通常编码同一氨基酸(摆动性)。ATG(RNA 中为 AUG)编码甲硫氨酸并作为起始密码子。第三位碱基的简并性让同义密码子家族共享前两位:GCN = 丙氨酸、CGN = 精氨酸。密码子优化算法在不改变蛋白的前提下按宿主 tRNA 丰度改写基因,利用的正是这一结构。
演算示例
CTT、CTC、CTA、CTG、TTA、TTG 全部编码亮氨酸,体现了简并性;ATG 编码甲硫氨酸并作为起始密码子,而 TAA、TAG、TGA 为终止密码子。单个碱基变化可能是同义的(CTT → CTC,仍是亮氨酸)、错义的(CTT → CAT,变成组氨酸)或无义的(TAC → TAG,产生终止子)——查表即可判断属于哪种情况。
适用场景
设计同义突变时查询编码某氨基酸的密码子。确认测序峰图中某个密码子对应的氨基酸。通过切换 DNA(T)与 RNA(U)形式来学习或讲授遗传密码结构。设计合成基因时可手动选密码子——例如在精氨酸的各密码子之间挑选,以避开编码区内被禁止的限制酶切位点。
常见问题
- 标准遗传密码共有多少个密码子?
- 共 64 个密码子:61 个编码 20 种氨基酸,3 个为终止信号。
- 哪个是起始密码子,它编码什么?
- ATG(RNA 中为 AUG)是起始密码子,编码甲硫氨酸。
- 三个终止密码子是什么?
- TAA、TAG、TGA(RNA 中为 UAA、UAG、UGA)终止翻译。
- 为什么多个密码子编码同一种氨基酸?
- 遗传密码具有简并性;冗余(尤其第三位碱基的摆动性)让多个密码子对应一个氨基酸,并提升对突变的耐受力。