氨基酸组成

氨基酸组成分析

分析蛋白质序列的氨基酸组成。

输入氨基酸序列以分析其组成。

工具描述

氨基酸组成分析将蛋白质序列分解为 20 种标准氨基酸的数量、百分比和质量贡献。适用于表征未知蛋白、比较序列和估算分子量。

使用说明

使用单字母氨基酸代码(例如 MKNFTGALA)或三字母代码(例如 Met-Lys-Asn-Phe)粘贴蛋白质序列。组成表、总残基数和分子量将即时计算。

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功能简介

氨基酸组成工具将蛋白质序列拆解为 20 种标准氨基酸各自的数量、百分比和质量贡献。它有助于表征未知蛋白、比较序列并估算分子量。

原理与公式

工具逐个残基扫描序列,统计每种氨基酸出现的次数,计算其占序列总长的百分比,并乘以残基质量得到质量贡献。将所有残基质量贡献相加,再加一个水(18.015 Da)即为分子量。组成还能揭示理化偏好,如疏水性或带电残基偏高。

演算示例

对序列 MKNFTGALA,分析显示 Met 1(10%)、Lys 1、Asn 1、Phe 1、Thr 1、Gly 1、Ala 2(20%),共 9 个残基,各质量贡献相加即得到总体分子量。

适用场景

估计蛋白质是否富含影响纯化的某些残基,如用于形成二硫键的半胱氨酸。比较来自不同物种同源蛋白的组成偏好。从粘贴的序列快速估算分子量和残基总数。

常见问题

氨基酸组成能告诉你关于蛋白质的什么?
它报告每种残基的数量、占序列的百分比和质量贡献,揭示电荷、疏水性和半胱氨酸含量等方面的偏好。
氨基酸百分比如何计算?
用该残基的数量除以序列总残基数,再乘以 100。
组成分析能估算分子量吗?
可以,将 20 种残基各自的质量贡献相加,再加一个水分子(18.015 Da)即得到分子量。
组成对纯化有什么意义?
高半胱氨酸提示二硫键,高疏水性影响去垢剂选择,带电残基指导离子交换策略,因此组成可指导方法选择。