氨基酸组成
氨基酸组成分析
分析蛋白质序列的氨基酸组成。
输入氨基酸序列以分析其组成。
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功能简介
氨基酸组成工具将蛋白质序列拆解为 20 种标准氨基酸各自的数量、百分比和质量贡献。它有助于表征未知蛋白、比较序列并估算分子量。
原理与公式
工具逐个残基扫描序列,统计每种氨基酸出现的次数,计算其占序列总长的百分比,并乘以残基质量得到质量贡献。将所有残基质量贡献相加,再加一个水(18.015 Da)即为分子量。组成还能揭示理化偏好,如疏水性或带电残基偏高。
演算示例
对序列 MKNFTGALA,分析显示 Met 1(10%)、Lys 1、Asn 1、Phe 1、Thr 1、Gly 1、Ala 2(20%),共 9 个残基,各质量贡献相加即得到总体分子量。
适用场景
估计蛋白质是否富含影响纯化的某些残基,如用于形成二硫键的半胱氨酸。比较来自不同物种同源蛋白的组成偏好。从粘贴的序列快速估算分子量和残基总数。
常见问题
- 氨基酸组成能告诉你关于蛋白质的什么?
- 它报告每种残基的数量、占序列的百分比和质量贡献,揭示电荷、疏水性和半胱氨酸含量等方面的偏好。
- 氨基酸百分比如何计算?
- 用该残基的数量除以序列总残基数,再乘以 100。
- 组成分析能估算分子量吗?
- 可以,将 20 种残基各自的质量贡献相加,再加一个水分子(18.015 Da)即得到分子量。
- 组成对纯化有什么意义?
- 高半胱氨酸提示二硫键,高疏水性影响去垢剂选择,带电残基指导离子交换策略,因此组成可指导方法选择。