核酸定量计算器
把 A260/A280/A230 读数换算成浓度、得率、纯度比值与摩尔浓度。
浓度(ng/µL)= A260 × 换算系数 × 稀释倍数 ÷ 光程。系数:双链 DNA 50,单链 DNA 33,RNA 40,寡核苷酸 33。
输入 A260 读数即可计算浓度。
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功能简介
A260 吸光度是估算核酸含量最快的方法,因为碱基在紫外区有很强的吸收。要把读数换算成 ng/µL,需要选对分子的换算系数、校正稀释与光程,并查看 260/280 与 260/230 两个比值,确认样品足够干净、可以用于下游实验。
适用场景
质粒小提或 PCR 纯化后可用它检查回收率;配制连接反应或测序反应前可用它归一化模板量;把 OD 读数换算成 pmol 则适合处理引物与寡核苷酸母液。纯度比值还能帮助判断样品是否需要额外洗涤或乙醇沉淀,再用于敏感的酶促步骤。
常见问题
- 为什么 DNA、RNA 和寡核苷酸的换算系数不同?
- 该系数表示 A260 等于 1.0 时对应的浓度,取决于每种分子每碱基的平均吸光能力:双链 DNA 为 50 ng/µL,单链 DNA 与寡核苷酸为 33 ng/µL,RNA 为 40 ng/µL。RNA 含尿嘧啶,单位质量吸收更强;而双链状态下碱基堆积减弱,所以单位质量的吸收低于单链。
- 纯净样品的 A260/A280 应该在什么范围?
- 纯化后的 DNA 通常在 1.7–1.9,RNA 在 1.9–2.1。比值偏低往往意味着蛋白、酚或乙醇残留;DNA 比值明显偏高则可能混有 RNA。该比值只是快速判断,遇到可疑结果应用凝胶电泳或荧光法定量进一步确认。
- A260/A230 反映什么问题?
- 干净的核酸 A260/A230 一般在 2.0–2.2。数值偏低提示提取过程中引入了胍盐、酚、EDTA、多糖或去污剂残留。这些污染物同时会抑制下游酶促反应,所以 230 比值偏低往往比 280 比值略低更需要警惕。
- 不知道片段长度能算 pmol/µL 吗?
- 不能。摩尔浓度需要分子量,而分子量取决于碱基数量——双链 DNA 每 bp 按 660 g/mol,单链 DNA 与寡核苷酸按 330,RNA 每个 nt 按 340。填入长度后即可用 pmol/µL =(ng/µL × 1000)/ 分子量计算,适合在配制反应前对引物、探针和短片段进行归一化。