酶动力学
酶动力学计算器
从底物-速率数据拟合 Michaelis-Menten 动力学,或直接计算反应速率。
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功能简介
酶动力学计算器从底物-速率数据拟合 Michaelis-Menten 参数,或直接计算反应速率。生物化学家和学生用它表征酶效率、比较催化剂并设计实验条件。
原理与公式
Michaelis-Menten 动力学将反应速率 v 表示为底物浓度的函数:v = Vmax × [S] / (Km + [S])。Vmax 是底物饱和时的最大速率,Km 是速率达到 Vmax/2 时的底物浓度。工具通过对 Lineweaver-Burk 变换(1/v 对 1/[S])做线性回归来拟合 Vmax 和 Km,并报告拟合的 R²;也可由输入的 Vmax、Km 和 [S] 直接计算 v。
演算示例
给定数据点(0.5, 0.18)、(1, 0.30)、(2, 0.48)、(5, 0.71)(单位为 mM 和 mM/min),拟合得到 Vmax 接近 1.0、Km 接近 1.0,因此在 [S] = Km 时速率约为 0.5,即 Vmax 的一半。
适用场景
从酶活时间曲线估算 Km 和 Vmax 以排序底物偏好。在选定底物浓度下预测速率以规划实验。讲授 Lineweaver-Burk 线性化以及 Km、Vmax 的含义。
常见问题
- 什么是 Michaelis-Menten 方程?
- v = Vmax × [S] / (Km + [S]),描述反应速率与底物浓度的关系。
- 如何从数据计算 Vmax 和 Km?
- 将 1/v 对 1/[S] 作图(Lineweaver-Burk 变换);线性回归的 y 截距为 1/Vmax,x 截距为 -1/Km,本工具自动完成该拟合。
- Km 能告诉你酶的什么信息?
- Km 是半最大速率时的底物浓度;Km 低表示表观亲和力高,Km 高表示对底物的亲和力低。
- 动力学拟合中 R² 多高算好?
- 越接近 1 说明数据越符合 Michaelis-Menten 行为;较低值提示底物抑制、协同性或测量误差,模型可能不适用。